Bioquímica 2: El enlace peptídico

Este tema es continuación al que trata sobre la estructura de los aminoácidos.  La forma de polimerización de los α-aminácidos es a través del enlace peptídico. La unión ocurre cuando el grupo carboxilo de un residuo condensa con el amino de otro y se libera una molécula de agua. COO– + NH3 → CO-NH + H2O El enlace peptídico no se ioniza, es un enlace plano. A partir de la unión de dos o más aminoácidos a través de un enlace peptídico, surgen los péptidos y las proteínas. La frontera entre péptido y proteína no se encuentra bien establecida y los bioquímicos se guían más por su estructura, función y tamaño para determinar si se trata de uno o de otro. Un bioquímico puede decir que considera proteína si ésta se compone como mínimo de 100 aminoácidos, otro podría decir que es a partir de 50. PÉPTIDOS NATURALES Tienen estructuras […]

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Bioquímica 1: Estructura de los aminoácidos

En esta entrada haré una mención sobre los aminoácidos. Los aminoácidos son los ladrillos fundamentales por los que se componen las proteínas. Los α-aminoácidos se caracterizan fundamentalmente por tener un grupo amino (NH2-NH3+), un carboxilo (COOH – COO–) y un protón unidos al carbono denominado carbono α (exceptuando la prolina). La cadena lateral R es característica para cada aminoácido y es lo que dará la gran riqueza y variación estructural y funcional a los péptidos y proteínas. Sus grupos ácido COOH y base NH2 hacen que un aminoácido pueda actuar como ácido o base, por ello se dicen que son moléculas anfóteras. A pH fisiológico, el grupo carboxilo está desprotonado (COO–) y el NH protonado (NH3). Según la orientación del grupo amino en relación con el carbono asimétrico, éstos se pueden denominar D o L. La forma L tiene el grupo amino a la izquierda (no hay que confundir con […]

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Ciclo de Krebs, parte 2

En el capítulo anterior vimos las reacciones que ocurren durante el ciclo de Krebs. En este hablaremos sobre su regulación y el carácter anfibólico del ciclo. El ciclo de Krebs conste básicamente en 10 pasos: 1: Condensación 2: Deshidratación 3: Hidratación 4: Reducción (deshidrogenación) 5: Descarboxilación oxidativa 6: Descarboxilación oxidativa 7: Fosforilación a nivel de sustrato 8: Reducción 9: Hidratación 10: Reducción En cada uno de estos pasos, se requieren enzimas para catalizar las reacciones. Mencionamos también en el primer capítulo que una enzima es un compuesto que suele acelerar reacciones espontáneas sin cambiar su naturaleza termodinámica; esto es, que si una reacción no es espontánea, por más enzima que se introduzca, la reacción no será posible. Las enzimas encargadas en el ciclo son las siguientes: 1) Citrato sintasa: cataliza la reacción de condensación del AcCoA con el oxalacético 2) Aconitasa: realiza el paso del citrato al cis-aconitato y también […]

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