Bioquímica 5: enzimas, funcionalidad de las proteínas.

Una versión avanzada de este tema se puede leer en el apartado Enzimología. En el tema anterior, se habló sobre las características del plegamiento proteico. Cuestión de vital importancia que otorga la funcionalidad a las proteínas. Como hemos visto en temas anteriores, las proteínas pueden clasificarse de diversas formas y otro criterio es clasificarlas como proteínas simples, compuestas por una única cadena polipeptídica o proteínas conjugadas que tienen una parte proteica y otra no proteica. Si ese conjugado es del tipo proteico, se le llamaría apoproteína; de lo contrario, se trataría de cofactores que al unirse a la proteína, forman la entidad biológica funcional. Muchas proteínas necesitan un ligando (una molécula unida a ellas) para poder funcionar. Las enzimas son proteínas con función catalítica, aunque también existen RNAs que al desempeñar funciones catalíticas se denominan ribozimas. Una enzima se unirá a su sustrato (S) para dar un producto (P), formando […]

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Echinopsis en flor

Se trata de un género de cactácea cuyas espectaculares flores se abren durante la noche y florecen sólo un día. Me es imposible no compartir este vídeo sin darle el crédito a Greg Krehel por sus impresionantes imágenes. Freaky Flowers: Echinopsis Cacti in Bloom from EchinopsisFreak on Vimeo. A montage of a dozen types of Echinopsis cactus flowers blooming. And wilting. And just generally showing off their mind-blowing colors. My favorite cactus flowerings from the 2014 blooming season. Echinopsis cactus flowers bloom overnight and the flowers last for only a day. Actually, the flowers are at their peak beauty for an hour or two at the most. That’s what turned me from a cactus enthusiast into a cactus photographer … the desire to try to preserve some aspect of their freaky beauty. Prior to becoming an Echinopsis addict a few years back, I had never owned a DSLR or image/video […]

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Cromatografía

La cromatografía es una técnica de separación de moléculas ampliamente utilizada en los laboratorios. El término fue acuñado en 1906 por el botánico ruso Mikhail Tswett, donde se pueden identificar las palabras chromas (color) y graphos (escritura). Él separó los pigmentos (las clorofilas) que obtenía de sus extractos vegetales haciéndolos pasar por una columna rellena de un material sólido poroso. En la acualidad, este término se aplica a una metodología consistente en la separación de los componentes de una mezcla que se encuentren disueltos en una fase móvil y que por sus características físicoquímicas, conseguirán desplazarse a distinta velocidad a través de una fase estacionaria. De aquí podríamos decir que el principio predominante es la retención selectiva. A continuación, haré una clasificación bastante simplificada sobre los tipos de cromatografía. Cromatografía plana: la fase estacionaria puede estar en una placa plana o en un papel. Como ejemplos están la cromatogragía en […]

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Apuntes de Bioquímica

La Bioquímica es un área apasionante, lleno de posibilidades y aplicaciones. En este apartado añadiré una serie de lecciones que he ido confeccionando para facilitar el estudio de la asignatura. Me he basado en el programa que se imparte en la carrera de Biología de la Universidad Complutense de Madrid, mi antigua profesora María Dolores Aragonés fue principal responsable para que adquiriera el mayor interés posible por la asignatura. Estoy elaborando el PDF “Lecciones de Bioquímica” con todos estos contenidos para su descarga. Temario Estructura de los aminácidos El enlace peptídico Estructuras de las proteínas Características del plegamiento proteico  Enzimas, funcionalidad de las proteínas Tipos de catálisis Cinética enzimática En desarrollo Bioenergética, parte 1 Bioenergética, parte 2 Ciclo de Krebs, parte 1 Ciclo de Krebs, parte 2 Ciclo de Krebs, parte 3 y cadena transportadora de electrones Glicolisis Todas las imágenes son del libro de texto “Principles of Biochemistry” Lehninger. […]

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Bioquímica 4: Características del plegamiento proteico.

En la entrada anterior vimos los principios sobre las principales estructuras que pueden adquirir los péptidos y las proteínas.  El plegamiento proteico se ve determinado por la secuencia, es espontáneo, secuencial y cooperativo. Realizado con la colaboración de otras proteínas. DETERMINADO POR LA ESTRUCTURA PRIMARIA: Casos extremos: Que una misma secuencia tenga distintos plegamientos. Ocurre por el entorno, si la misma secuencia está inmersa en una secuencia de aminoácidos favorecedora de alfa-hélice, entonces se plegará en alfa-hélice (excepto si tiene Pro). Una cosa es la tendencia intrínseca de cada secuencia y otra el entorno. Distintas secuencias se pueden plegar igual como ocurriría en el caso que dos secuencias distintas tengan el mismo patrón de hidrofobicidad. Que dos secuencias distintas tengan el mismo plegamiento. EL PLEGAMIENTO ES ESPONTÁNEO: Un determinado plegamiento es favorecido por el hecho que la variación de energía libre sea igual a cero. En un sistema abierto, es […]

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