Enzimología 2: Esquema cinético de los procesos

Esquema cinético de los procesos enzimáticos. Índice Empezamos este tema con un abordaje simple y sencillo: el caso de una reacción en el que hay un único sustrato y un único producto. A tiempo cero (0) de la reacción tenemos dos especies E y S (enzima y sustrato) en el que se forma el complejo ES, esta formación vendrá gobernada por una constante cinética denominada k1 o constante de asociación ES. Esta constante representa la probabilidad que se forme esta asociación si los elementos enzima y sustrato se encuentran. La cantidad de veces en las que se encuentren estos dos elementos viene condicionado por las concentraciones de la enzima y el sustrato [E] y [S] (representamos con corchetes el término concentración), y debido a este hecho, se trata de una reacción de segundo orden en el que el tiempo y la concentración son protagonistas: (s-1 M-1). Sin embargo, este proceso […]

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Enzimología

Los temas que se tratan aquí, son complementarios y amplían la información proporcionada en las lecciones de Bioquímica. Gracias al profesor Jesús Pérez Gil de la Universidad Complutense de Madrid, puedo compartir lo que aprendí sobre Biotecnología de Enzimas. Temas: Concepto de enzima y actividad enzimática Esquema cinético de los procesos Representaciones: Lineweaver-Burk, Hanes-Woolf, Eadie-Hostee, y Eisenthal y Cornish-Bowden Influencia de factores ambientales en la catálisis enzimática. * Efecto de pH, fuerza iónica y temperatura. Termoinactivación y enzimas termoestables. Activación e inhibición enzimática. * Inhibidores reversibles. Inhibición competitiva, mixta y acompetitiva. Inhibición por producto y por exceso de sustrato. Efectos alostéricos y cooperativos. Modelos de cooperatividad. Inhibidores irreversibles. Marcadores de afinidad, sustratos suicidas y análogos del estado de transición. Cinética multisustrato. * Sistema de representación y nomenclatura de Cleland. Mecanismos ordenado, al azar y ping‐pong: métodos de representación gráfica. Inhibición por productos de reacción y caracterización del mecanismo cinético. Mecanismos de […]

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Enzimología 1: Concepto de enzima y actividad enzimática.

Índice Para entender este tema, hay que hacer un pequeño ejercicio de abstracción con respecto a lo que es una enzima. En primer lugar hay que establecer lo que es una coordenada de reacción: en un sistema en que se dé una reacción, la evolución del sistema en el tiempo va desde el estado inicial hasta que el sustrato se convierte en producto. Se puede usar en término de cualquier variable, como la energía libre. En el estado inicial, la energía libre del sistema es la energía libre del sustrato y la energía libre del sistema al final, es la del producto. Se puede definir a ΔG como la ENERGÍA LIBRE, si es negativo es porque la energía libre del producto es inferior a la del sustrato =-ΔG, es un proceso termodinámicamente favorable y se ha liberado energía. Si ΔG fuera positivo, habría que aportar esa energía libre al sistema para […]

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