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Introducción a la Resonancia Magnética Nuclear o RMN (NMR)

13/08/2018 admin Biofísica, Bioquímica

Esta es una introducción general sobre espectroscopía por RESONANCIA MAGNÉTICA NUCLEAR (RMN) A continuación, enlazo una serie de artículos que se han ido confeccionando en función del grado de detalle con respecto a esta técnica espectroscópica. Me centro fundamentalmente en las bases físicas y sus aplicaciones para la caracterización estructural de complejos biológicos. Theoretical introduction to NMR (en inglés), texto complementario a la introducción general de mi Tesis Doctoral. ¿Qué es la RMN? (Texto para alumnos de programas de Máster) Podcast de la entrevista a Marta Bruix en el programa “A Hombros de Gigantes” de RNE. ¿Qué peligros puede entrañar la Resonancia Magnética Nuclear? ¿Por qué la RMN? Los procesos celulares de los organismos superiores se ven regulados por moléculas que actúan conjuntamente en forma de grandes complejos moleculares en los que las interacciones juegan un papel fundamental. El conjunto de estas redes de interacción se conoce como interactoma. A […]

¿Qué es la RMN? (Texto para alumnos de programas de Máster)

10/03/2017 admin Biofísica, Biología, Bioquímica

En el laboratorio de Resonancia Magnética Nuclear de alto campo del CSIC nos encargamos de aplicar esta técnica para caracterizar moléculas biológicas fundamentalmente. Nosotros nos dedicamos al área de la Biología Estructural, la cual se encarga del estudio de las propiedades estructurales y dinámicas de las proteínas, ácidos nucleicos y otras macromoléculas dentro de un contexto biológico. La Resonancia Magnética Nuclear o RMN es una técnica espectroscópica que se aprovecha de las propiedades mecanocuánticas de los núcleos de los átomos conocido como spin. Por RMN se determinan las posiciones de cada uno de los átomos que constituyen la molécula. Para ello, se necesita que la muestra se encuentre normalmente en disolución acuosa (como cuando se disuelve azúcar en agua). De esta forma se puede estudiar su plegamiento (forma) y dinámica (movimiento), lo cual es de gran interés para el desarrollo de fármacos. Del mismo modo, la RMN en estado sólido […]

Curiosidades científicas de la vida cotidiana

25/12/2015 admin Biología, Bioquímica, divulgación

Para un científico no es difícil encontrar relaciones físicas, biológicas, químicas y matemáticas en el mundo que le rodea de manera automática; sin embargo, muchas veces no contamos con información suficiente que explique un fenómeno. En estos casos, la curiosidad es un factor determinante y tener un buen pensamiento crítico para saber si al consultar la razón de una observación se adapta al método científico. El veneno está en la dosis: botulismo y botox. En ocasiones vemos latas, tetrabricks de zumos y otros productos hinchados. Se desaconseja tajantemente consumirlos ya que podrían contener una bacteria llamada Clostridium botulinum. Esta bacteria sintetiza una toxina que actúa sobre el sistema nervioso dando lugar a la enfermedad conocida como botulismo a través de la ingesta de productos en los que ha crecido la bacteria, dando lugar a desenlaces fatales. Curiosamente, tras investigar el modo de acción de esta neurotoxina, se ha empleado en menor dosis para usos […]

Bioquímica 7: cinética enzimática

05/12/2015 admin Biología, Bioquímica, divulgación

En la entrada anterior, se habló sobre los distintos tipos de catálisis que podemos encontrar en las enzimas. Para seguir la actividad de una enzima y poder desarrollar inhibidores eficaces, ver cuál es la temperatura, el pH y otras variables físicoquímicas que determinan el ambiente óptimo para su máxima funcionalidad; los bioquímicos empleamos una serie de ecuaciones y representaciones de la cinética de la reacción. Estas representaciones miden la velocidad (no en parámentros termodinámicos) de la reacción en presencia o ausencia de inhibidores, variando las distintas condiciones del medio. Propongamos los siguientes supuestos: [S]>>[E] Esto quiere decir que la concentración de sustrato es mucho mayor que la de enzima. Mediremos la concentración de los intermediarios de reacción (complejo enzima-sustrato), a lo largo del tiempo disminuirá la concentración de enzima libre al haber exceso de sustrato. Entonces aparecerá el complejo enzima-sustrato ES. Estado estacionario: Llegamos al punto en que la concentración […]

Bioquímica 6: tipos de catálisis

30/11/2015 admin Biología, Bioquímica, divulgación

En el tema anterior, se habló sobre las enzimas. En este se tratará sobre el tipo de catálisis que llevan a cabo. Los mecanismos de catálisis son fundamentalmente cuatro: Catálisis por aproximación: mediante el establecimiento de interacciones E-S. Reduce la entropía para que la reacción sea más favorable gracias a los efectos de proximidad y orientación. Catálisis ácido-base Catálisis covalente Catálisis por distorsión CATÁLISIS POR APROXIMACIÓN: Ocurre en todas las enzimas. Como su nombre indica, aproxima los sustratos (reactantes) y hace que la probabilidad de encuentro entre ellos sea mayor. La reacción puede ser uni o bimolecular. CATÁLISIS ÁCIDO-BASE: La enzima favorece la reacción actuando como ácido o como base. Se trata de un tipo de catálisis bastante frecuente en las enzimas. Los residuos de las enzimas favorecen la reacción actuando como ácido o como base (o ambos) mediante la transferencia de protones al activar la molécula de agua haciéndolo […]