Echinopsis en flor

Se trata de un género de cactácea cuyas espectaculares flores se abren durante la noche y florecen sólo un día. Me es imposible no compartir este vídeo sin darle el crédito a Greg Krehel por sus impresionantes imágenes. Freaky Flowers: Echinopsis Cacti in Bloom from EchinopsisFreak on Vimeo. A montage of a dozen types of Echinopsis cactus flowers blooming. And wilting. And just generally showing off their mind-blowing colors. My favorite cactus flowerings from the 2014 blooming season. Echinopsis cactus flowers bloom overnight and the flowers last for only a day. Actually, the flowers are at their peak beauty for an hour or two at the most. That’s what turned me from a cactus enthusiast into a cactus photographer … the desire to try to preserve some aspect of their freaky beauty. Prior to becoming an Echinopsis addict a few years back, I had never owned a DSLR or image/video editing software. The cacti shown in this video come from my collection. The evening when it looks like a plant’s flowers are about to bloom, I bring it indoors to image. Most of the clips in this montage show approximately 8 hours of change as the flowers open and bloom. A little more than halfway through the montage, there’s a series of three clips showing different views of a 24-hour period in the life of a yellow-flowered ‘Daydream’ plant. Six flowers that opened the night before I started filming wilt to nothingness and another 4 flowers grow dramatically and then open. This series of ‘Daydream’ clips is followed by another three showing other types of flowers wilting. These additional wilting clips are also taken over a daylong period. The question I’m asked most often about my cactus flower still images and timelapses is whether I’ve “Photoshopped” them, that is, have… continúa

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Cromatografía

La cromatografía es una técnica de separación de moléculas ampliamente utilizada en los laboratorios. El término fue acuñado en 1906 por el botánico ruso Mikhail Tswett, donde se pueden identificar las palabras chromas (color) y graphos (escritura). Él separó los pigmentos (las clorofilas) que obtenía de sus extractos vegetales haciéndolos pasar por una columna rellena de un material sólido poroso. En la acualidad, este término se aplica a una metodología consistente en la separación de los componentes de una mezcla que se encuentren disueltos en una fase móvil y que por sus características físicoquímicas, conseguirán desplazarse a distinta velocidad a través de una fase estacionaria. De aquí podríamos decir que el principio predominante es la retención selectiva. A continuación, haré una clasificación bastante simplificada sobre los tipos de cromatografía. Cromatografía plana: la fase estacionaria puede estar en una placa plana o en un papel. Como ejemplos están la cromatogragía en capa fina y la cromatografía en papel. Suele tener fines analíticos (para analizar cómo está compuesta la mezcla) ya que es más complicado y menos práctico recuperar los elementos separados para emplearlos en experimentos posteriores. Cromatografía en columna: la fase estacionaria está contenida dentro de una columna. En los laboratorios de Bioquímica donde he trabajado, esta ha sido la técnica de separación por excelencia y puede aplicarse de igual forma para fines analíticos y preparativos ya que las moléculas separadas se pueden recuperar con mayor facilidad para emplearlas en experimentos posteriores. Aquí podríamos identificar la cromatografía de gases y la cromatografía líquida. Como he comentado antes, esta es una clasificación simple y dependiendo del criterio, podemos hacer distintas listas y clasificar las posibles combinaciones de técnicas y agruparlas en diferentes clases como el tipo de soporte, la clase de interacción, cómo es la fase estacionaria, etc. En este apartado me concentraré… continúa

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Apuntes de Bioquímica

La Bioquímica es un área apasionante, lleno de posibilidades y aplicaciones. En este apartado añadiré una serie de lecciones que he ido confeccionando para facilitar el estudio de la asignatura. Me he basado en el programa que se imparte en la carrera de Biología de la Universidad Complutense de Madrid, mi antigua profesora María Dolores Aragonés fue principal responsable para que adquiriera el mayor interés posible por la asignatura. Estoy elaborando el PDF “Lecciones de Bioquímica” con todos estos contenidos para su descarga. Temario Estructura de los aminácidos El enlace peptídico Estructuras de las proteínas Características del plegamiento proteico  Enzimas, funcionalidad de las proteínas Tipos de catálisis Cinética enzimática En desarrollo Bioenergética, parte 1 Bioenergética, parte 2 Ciclo de Krebs, parte 1 Ciclo de Krebs, parte 2 Ciclo de Krebs, parte 3 y cadena transportadora de electrones Glicolisis Todas las imágenes son del libro de texto “Principles of Biochemistry” Lehninger. Las imágnes son de acceso libre cedidos por la editorial.

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Bioquímica 4: Características del plegamiento proteico.

En la entrada anterior vimos los principios sobre las principales estructuras que pueden adquirir los péptidos y las proteínas.  El plegamiento proteico se ve determinado por la secuencia, es espontáneo, secuencial y cooperativo. Realizado con la colaboración de otras proteínas. DETERMINADO POR LA ESTRUCTURA PRIMARIA: Casos extremos: Que una misma secuencia tenga distintos plegamientos. Ocurre por el entorno, si la misma secuencia está inmersa en una secuencia de aminoácidos favorecedora de alfa-hélice, entonces se plegará en alfa-hélice (excepto si tiene Pro). Una cosa es la tendencia intrínseca de cada secuencia y otra el entorno. Distintas secuencias se pueden plegar igual como ocurriría en el caso que dos secuencias distintas tengan el mismo patrón de hidrofobicidad. Que dos secuencias distintas tengan el mismo plegamiento. EL PLEGAMIENTO ES ESPONTÁNEO: Un determinado plegamiento es favorecido por el hecho que la variación de energía libre sea igual a cero. En un sistema abierto, es la entropía total (sistema + entorno) y la entalpía. Cuando se aproxima una molécula polar a las moléculas de agua, forman caltratos que consisten en n moléculas de agua agrupadas y muy contraídas producidas por interacciones desfavorables. Cuando la proteína se pliega, los residuos apolares quedarán hacia adentro y los polares hacia fuera (efecto hidrófobo). Las moléculas apolares crearán interacciones favorables entre ellas y las polares crearán interacciones favorables con las moléculas de agua. Durante el plegamiento de la proteína, se experimenta una variación de entropía hasta llegar al mínimo una vez se encuentre completamente plegada. Aunque la entropía de la proteína haya bajado, la del agua ha aumentado y se podría decir que el balance (la variación de entropía del plegamiento) es positivo. EL EFECTO HIDRÓFOBO: La presencia del agua será determinante para que se presenten una serie de estructuras determinadas, favoreciendo el internamiento de las regiones apolares. ENTALPÍA:… continúa

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Glicolisis

En el artículo anterior vimos cómo se reoxidan las coenzimas reducidas en la cadena transportadora de electrones y qué es el desacoplamiento electrónico. En este veremos cómo se rompen los carbohidratos que entrarán posteriormente en el ciclo de Krebs. La glicolisis es el proceso por el cual, los hidratos de carbono se rompen en fragmentos más pequeños que posteriormente entrarán en el ciclo de Krebs al nivel del AcCoA. Debemos recalcar que no siempre irán al ciclo, sino que pueden adoptar rutas alternativas como la ruta de las pentosas (la veremos más adelante) o se pueden almacenar en forma de glucógeno para su posterior degradación. Las hexosas (poseen esqueletos de seis átomos de carbono) se romperán en fragmentos de 3, dando lugar a una producción de 2 moléculas de ATP por fosforilación a nivel de sustrato y sufrirán una posterior oxidación que aportará 2NADH y protones. Este proceso ocurre en el citosol de la célula. El hecho de que sea un proceso aeróbico o no; no está definido en este proceso, sino el destino de los fragmentos de 3 átomos de carbono. Al mismo tiempo, hay una ruta reversa a la de la glicolisis que es la gluconeogénesis que consiste en ir uniendo los fragmentos C3 (tres átomos de carbono) para obtener un C6 (hexosa, un compuesto de seis átomos de carbono). Energéticamente, todos los azúcares son iguales y por tanto, el balance energético final de todas las hexosas será igual. Otra cosa es si una hexosa tiene mayor poder edulcorante y en consecuencia, se tenga que consumir en menor cantidad. PASOS DE LA GLICOLISIS 1) Activación: Como mencionamos en el primer artículo, las moléculas deben activarse obteniendo una conformación más inestable para ser reactivas. El primer paso para romper las hexosas consiste en su activación en forma de ésteres… continúa

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